Shoot 1UP позволяет игрокам обойти традиционную систему управления одним кораблём в шутерах и управлять целой армадой шаттлов одновременно. С самого начала доступны все виды кораблей, что позволяет устроить настоящий хаос на экране.
История начинается с разрушения вашего мира, после чего вам предстоит возглавить выживший батальон и уничтожить инопланетные силы, представленные монстрами и механическими щупальцами. В вашем распоряжении 30 кораблей, которыми можно управлять одновременно.
В Shoot 1UP также предусмотрена возможность кооперативной игры, что позволяет участвовать в сражениях сразу 60 шаттлам. Создавайте фаланги из кораблей, чтобы запускать плазменные шнуры и уничтожать врагов.
Арсенал оружия пополняется по мере присоединения новых шаттлов, а некоторые корабли можно принести в жертву ради благой цели.
В игре представлены два уровня сложности: нормальный и хардкор. Кампания состоит из 6 сложных уровней, каждый из которых предлагает уникальный вызов и типы врагов. В конце уровней вас ожидают напряжённые битвы с боссами, включая девушку-босса с механической грудью.
Также присутствуют таблицы лидеров, показывающие ваши личные достижения и успехи игроков по всему миру.