Paranautical Activity: Deluxe Atonement Edition — это динамичный шутер от первого лица, напоминающий классические игры Doom и Quake. Особенность игрового процесса заключается в процедурной генерации оружия противников и окружения, что делает каждое прохождение уникальным и непредсказуемым. Благодаря полной рандомизации, испытания постоянно меняются и не повторяются, поэтому подготовиться к ним заранее невозможно. За выполнение определённых задач игрок получает достижения из списка, включающего 45 наград.
Во время прохождения однопользовательской кампании игрок столкнётся с более чем 40 видами монстров и десятком боссов разного уровня сложности. Каждая битва сопровождается энергичной и мощной музыкой в стиле дабстеп, идеально подходящей для динамичного и жестокого экшена. Также в игре присутствует исследовательский контент, позволяющий изучать окружение в поисках нового оружия, боеприпасов и секретных мест, открывающих доступ к дополнительному контенту.