Freedom Planet 2 предоставляет пользователям возможность вновь посетить мир Avalice, где на этот раз возникла угроза из морских глубин. Водный дракон Merga, ранее заключённый в кристаллической клетке, сумел вырваться на свободу. Кроме того, ключевые персонажи из оригинала оказываются по разные стороны конфликта в сиквеле.
Вторая часть сохраняет свой жанр скоростного платформера, вдохновлённого ранними играми про Sonic с 16-битной консоли. В продолжении доступны три режима: приключенческий, классический и арена. Добавлена возможность активировать автоматическую защиту от вражеских атак, а механика возрождения была переработана.
Mila — собака, использующая свои уши как крылья для полёта.
Все героини доступны с самого начала. Они могут атаковать противников в ближнем бою, бегать, прыгать, разгоняться, плавать под водой, сворачиваться клубком и выполнять другие действия. Их характеристики (сила, скорость, броня и прочее) можно улучшить с помощью различных зелий. Также на героинь можно надевать талисманы и амулеты, предоставляющие различные бонусы.