Spirits — это уникальная игра, рассказывающая о путешествии домой духов. Осенью опавшие листья превращаются в белых существ, похожих на человекообразных грибов. Они ищут порталы, чтобы покинуть этот мир до наступления зимы.
В Spirits нет диалогов, а сюжет подаётся без текста. Это двухмерная головоломка с видом сбоку, основанная на концепции «Леммингов». Игроку нужно провести группу существ к концу разрушаемого уровня. Несмотря на свою духовную форму, листья не умеют летать и передвигаются по земле самостоятельно.
Без помощи геймера души листьев могут попасть в ловушки и погибнуть. Также их сдувает ветром. Игроку нужно помочь листьям добраться от точки А до точки Б, и чем больше выживет, тем лучше. Управлять листьями напрямую нельзя, игрок может только помогать им, меняя потоки воздуха или блокируя их, строя мосты, создавая облака и копая землю. Эти действия помогут проложить безопасный путь к порталу. Но для этого придётся пожертвовать одним из подопечных.
Игра состоит из 46 этапов, каждый из которых представляет собой нелинейный пазл. Сложность головоломок постепенно нарастает, и выполнять задания можно разными способами. Можно попробовать прокопать длинный туннель к выходу или построить импровизированную лестницу.