Natural Selection 2 — это захватывающий многопользовательский проект, сочетающий в себе элементы шутера от первого лица и стратегии в реальном времени. Исход сражений зависит от выбранной тактики обеих сторон конфликта.
В игре сталкиваются отряды человеческой цивилизации и космические ксеноморфные существа Kharaa, обладающие мощными телами и острыми клыками, способными мгновенно уничтожать человеческую плоть. Люди используют стандартное вооружение: автоматы, дробовики, пистолеты, кластерные и осколочные гранаты, а также многое другое.
У ксеноморфов есть пять классов со специальными способностями, которые нужно комбинировать для достижения максимальной эффективности.
Игровой процесс второй части франшизы «Естественный отбор» состоит из двух уровней. Во время напряжённых битв от первого лица между враждующими сторонами два игрока, выступающих в роли командиров своих рас, осматривают поле боя с помощью изометрической камеры. У них есть набор способностей, которые могут навредить противникам и помочь союзникам в опасных ситуациях.
Например, командир людей имеет доступ к специальным каналам на карте, по которым можно передавать патроны и аптечки, а лидер ксеноморфов может заражать территории и создавать больше монстров, управляемых искусственным интеллектом, чтобы помочь игрокам своей команды.